Χώρισε δύο χρόνια μετά το γάμο του με τη νεαρή Μαρία Ιωαννίδου, ο πρώην δήμαρχος Θεσσαλονίκης Γιάννης Μπουτάρης
Το χωρισμό του αποκάλυψε ο ίδιος σε συνέντευξη με αφορμή το βιβλίο του «Εξήντα χρόνια τρύγος».
Με τη Μαρία Ιωαννίδου ήταν παντρεμένος από το 2018. Ο 76χρονος τότε δήμαρχος Θεσσαλονίκης αποφάσισε να ανταλλάξει όρκους αγάπης με τη σύντροφό του και να παντρευτεί με σύμφωνο συμβίωσης, όπως και έγινε.
Το ζευγάρι Μπουτάρη – Ιωαννίδου, παντρεύτηκε το 2018 και ζούσε μέχρι πρότινος σε ένα διαμέρισμα στον πεζόδρομο της Αγίας Σοφίας, στο κέντρο της Θεσσαλονίκης, μαζί με τα δύο παιδιά της Μαρίας Ιωαννίδου.
Όμως ήλθε η ώρα του χωρισμού. Ο Γιάννης Μπουτάρης το επιβεβαίωσε και δημοσίως λέγοντας:
«Τώρα δεν είμαι με καμία. Η γυναίκα που αγαπούσα πέθανε. Μ’ αυτήν ήμουν ερωτευμένος από τα δεκαέξι μου. Κάναμε παιδιά, εγγόνια, χωρίσαμε… Μόνος μένω. Παντρεύτηκα ξανά πριν από δύο χρόνια, αλλά ο γάμος απέτυχε».